No dia 27 de janeiro de 2025, o Miraheze atualizou a versão do software MediaWiki, que é usado como base para o site de hospedagem de wikis onde a CompactoPedia estava hospedada, e com isso, diversas wikis foram afetadas, com as páginas bagunçadas, e vários arquivos e conteúdos bugaram e/ou sumiram. Na CompactoPedia não foi diferente: as categorias desapareceram, e a página principal não aparecia mais direito, além de páginas que foram perdidas ou bagunçadas.
As 15 horas desse dia, foi relatado que a CompactoPedia voltou a "normalizar", ou seja, provavelmente já estão corrigindo os problemas nas wikis.
